国家高新技术企业抽查未通过，不仅会被取消高企资格，无法继续享受高企各项优惠政策，还将由税务机关追缴已享受的高企税收优惠，并按《税收征管法》规定征收滞纳金。
如果企业存在《税收征管法》第六十三条规定的偷税行为的，税务机关将按相关规定进行处罚。市税务局将积极向上级税务部门建议将高新技术企业申请认定过程中存在严重弄虚作假行为的企业纳入偷税范畴。
一、重点抽查的高新技术企业
1.高企火炬统计年报中，研发投入占比低于高企认定要求的企业；
2.高企火炬统计年报中，年主营收入下降高于10%的企业；
3.过去三年纳税总额低于各级应给予的高新技术企业补贴额度的企业；
4.过去三年发生过重大环保、质量安全等事故和列入非正常经营名录内的企业；
5.高企评分71-75分的企业；
6.累计两年未按规定时限报送年度发展情况报表的企业。
二、高新技术企业抽查内容
1.详述主要产品与知识产权的关联性
2.研发活动与高新领域的关联性
3.详述高新技术产品的核心技术
4.高新产品收入与销售发票的关联性
5.提供企业科技人员相关信息
6.研发费用、高新收入占比的合理性
7.将相应软件著作权的软件产品运行界面进行截图展示
8.详述高新技术产品（服务）收入的归集依据
三、高新技术企业抽查如何应对
收到抽查通知的企业也不必慌张，准备好原先申请材料，立足于现有材料，在抽查过程中不拖延应对；只要立足高企指引，言之有据，和原先申报材料逻辑通顺即可。
01、财务部门需要注意：
a.准备好申报当年上传的财务资料，如审计报告、研发费用辅助账、纳税证明以及高新产品收入的销售发票及合同；现有的审计报告、研发费用辅助账等等也准备好，方便应对抽查；
b.纳入规模以上企业国家统计数据库的企业，应及时核查报送的研发数据是否与火炬系统、高企年报数据一致；如不一致应及时更正报表报送，并出具相应证明。
02、研发部门需要注意：
a.准备好知识产权相关资料，如申请材料、操作视频、证书文件等；通过受让、受赠和并购方式获得的知识产权还应准备国家知识产权局相关部门出具的备案信息等证明材料；
b.要对每个科技成果转化项目的来源、主要内容和转化对应形式（产品和样机）给予列表说明；
03、行政人事部门需要注意：
a.准备好研发人员名单、工资表、社保缴费明细及员工相关资料（如学历证明、劳务合同等）；
b.准备好研发人员的个税申报情况，将研发人员在职离职情况做好登记，对于离职的科技人员要能够给予说明。
四、高新技术企业抽查问题回答建议
1、说明知识产权为何申请时间集中
建议：结合公司的实际研发技术，具备条件申请知识产权的占少数且完成时间不一；公司为减轻工作量，一般是累积到一定数量再一同申请知识产权。集中申请知识产权方便公司全面保护，公司能够对知识产权进行统一布局、统一规划。
2、阐述研发活动与高新领域的关联性
建议：企业开展研发活动，会根据公司实际销售产品，参考同行业较为优秀的企业、知名高校、相关学术论文及展会、论坛等等获取相关信息，还将参考其他生产相同产品企业的高新领域选择，组织公司相关人员开展会议讨论，结合公司情况确定研发方向和符合的高新领域。
3、阐述高新产品与高新领域的关联性
建议：公司生产销售产品种类多，涉及的技术领域覆盖范围较广，也有跨行业的核心技术。在申报前，公司参考了其他同行业申请相同知识产权、销售相同产品的企业所选领域，再结合公司实际研发情况选择高新领域，开展研发活动，生产高新产品。
4、解析高新产品收入与销售发票的关联性
建议：公司的销售发票是根据税务局要求，并结合公司实际经营范围和客户需求开具的；开票明细是根据税局给定的产品目录进行选择。
5、说明研发费用的合理性
建议：公司财务人员严格按照高企要求建立研发支出会计科目，详细记录各项研发活动发生的全部费用，并按要求归集，编制研发费用辅助账。
6、详述高新技术产品（服务）收入的归集依据
建议：公司高新技术产品（服务）收入是严格按照《高新技术企业认定管理工作指引》归集的。企业通过研发和相关技术创新活动，再进行科技成果转化后生产产品销售或提供技术性服务取得的收入即为高新技术产品收入。
五、高新技术企业如何避免被抽查
注意研发费用总额占销售收入的比例，不可低于5%；
企业的高新产品收入占销售收入60%及以上，且收入保持稳定；
企业发生更名或与认定条件有关的重大变化（如分立、合并、重组以及经营业务发生变化等）应在三个月内向认定机构报告；
避免发生重大环保、质量安全等事故和被列入非正常经营名录；
按时申报火炬年报、统计局年报、科创委月报及高企年度发展情况表。
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